Le climat de Puerto Peñasco est subtropical désertique, avec un hiver très doux et un été très chaud et humide.
La ville est située dans la partie la plus septentrionale du golfe de Californie, dans l'État de Sonora. Nous sommes dans la partie côtière du désert d'Altar.
L'hiver, de décembre à février, est très doux, mais la nuit il peut faire froid.
De juin à novembre, mais avec une probabilité plus élevée d'août à octobre, la ville peut être affectée par les restes des ouragans du Pacifique, qui montent des régions tropicales après avoir traversé la Basse-Californie. Cependant, les ouragans sont rares en juin, le mois où ils sont les plus fréquents est septembre, et historiquement, ils ne se sont jamais produits en novembre.
La température moyenne du mois le plus froid (janvier) est de 14,2 °C, celle du mois le plus chaud (août) est de 31,6 °C. Voici les températures moyennes.

Les précipitations totalisent 65 mm par an : elles sont donc au niveau désertique. Voici les précipitations moyennes.

La température de la mer varie entre 17 °C et 30 °C. La mer est assez froide de décembre à avril, alors qu'elle devient très chaude de juillet à octobre. Voici les températures moyennes de la mer.

Quand partir

La meilleure période pour visiter Puerto Peñasco se situe entre novembre et avril. L’hiver, de décembre à février, est généralement une saison douce et ensoleillée, bien qu’il puisse parfois faire un peu froid (surtout en décembre et janvier). On peut donc choisir les mois de mars, avril et novembre.